Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc13D3YV10 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 543.6 ms