Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms