Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5483B2RV77 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5483B2RV77 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms