Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprbB2RU80 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms