Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms