Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms