Protein–RNA interactions for Protein: B1AV28

Gm14862, Predicted gene 14862, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14862B1AV28 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm14862B1AV28 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm14862B1AV28 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms