Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-M5A7VMS3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-M5A7VMS3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H2-M5A7VMS3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H2-M5A7VMS3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-M5A7VMS3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-M5A7VMS3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-M5A7VMS3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-M5A7VMS3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-M5A7VMS3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-M5A7VMS3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-M5A7VMS3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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H2-M5A7VMS3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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H2-M5A7VMS3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M5A7VMS3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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