Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp2c2A7L9Z8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2c2A7L9Z8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms