Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp8b5A3FIN4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b5A3FIN4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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