Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms