Protein–RNA interactions for Protein: A2BIE1

Qser1, Glutamine and serine-rich 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Qser1A2BIE1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Qser1A2BIE1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Qser1A2BIE1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms