Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl41A2AUC9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl41A2AUC9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms