Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AgrnA2ASQ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AgrnA2ASQ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms