Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pramef25A2ASI9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pramef25A2ASI9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pramef25A2ASI9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pramef25A2ASI9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pramef25A2ASI9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pramef25A2ASI9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef25A2ASI9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms