Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scn3aA2ASI5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scn3aA2ASI5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms