Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syndig1A2ANU3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms