Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms