Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm12A2AJ77 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms