Protein–RNA interactions for Protein: A2AE21

Zfp300, Zinc finger protein 300, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp300A2AE21 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp300A2AE21 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp300A2AE21 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms