Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprfA2A8L5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprfA2A8L5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms