Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Calcoco2A2A6M5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calcoco2A2A6M5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms