Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nlrp1bA1Z198 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms