Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUH6

Rbm8a2, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm8a2A0A0N4SUH6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms