Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22246-201ENSMUST00000082478 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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