Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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