Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn12Q9ET43 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn12Q9ET43 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms