Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Ccdc39Q9D5Y1 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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