Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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