Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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Sgo1Q9CXH7 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Sgo1Q9CXH7 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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Sgo1Q9CXH7 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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Sgo1Q9CXH7 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Sgo1Q9CXH7 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sgo1Q9CXH7 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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