Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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Hdac9Q99N13 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hdac9Q99N13 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hdac9Q99N13 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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