Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm22013-201ENSMUST00000158788 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
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