Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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Rbbp4Q60972 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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Rbbp4Q60972 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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Rbbp4Q60972 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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Rbbp4Q60972 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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Rbbp4Q60972 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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Rbbp4Q60972 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms