Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms