Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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