Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
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ptchd1Q14B62 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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ptchd1Q14B62 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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ptchd1Q14B62 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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ptchd1Q14B62 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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ptchd1Q14B62 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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ptchd1Q14B62 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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ptchd1Q14B62 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms