Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd1Q01822 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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