Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxc11P31313 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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