Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RxraP28700 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RxraP28700 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RxraP28700 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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RxraP28700 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RxraP28700 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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