Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cbx4O55187 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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