Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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Scarb2O35114 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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Scarb2O35114 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Scarb2O35114 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Scarb2O35114 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Scarb2O35114 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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Scarb2O35114 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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Scarb2O35114 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Scarb2O35114 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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