Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Smim18J3QNP2 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Smim18J3QNP2 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms