Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Gm20518E9Q548 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm20518E9Q548 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm20518E9Q548 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm20518E9Q548 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm20518E9Q548 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms