Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.41
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