Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms