Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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Ccdc170D3YXL0 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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Ccdc170D3YXL0 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm26331-201ENSMUST00000082824 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm24205-201ENSMUST00000082953 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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Ccdc170D3YXL0 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc170D3YXL0 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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Ccdc170D3YXL0 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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Ccdc170D3YXL0 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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Ccdc170D3YXL0 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc170D3YXL0 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc170D3YXL0 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc170D3YXL0 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc170D3YXL0 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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