Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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Rtf1A2AQ19 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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Rtf1A2AQ19 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Rtf1A2AQ19 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Rtf1A2AQ19 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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Rtf1A2AQ19 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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Rtf1A2AQ19 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Rtf1A2AQ19 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rtf1A2AQ19 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rtf1A2AQ19 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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