Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms