Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Rabgef1Q9JM13 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms