Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Zbed3Q9D0L1 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
Zbed3Q9D0L1 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Zbed3Q9D0L1 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
Zbed3Q9D0L1 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Zbed3Q9D0L1 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Zbed3Q9D0L1 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Zbed3Q9D0L1 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Zbed3Q9D0L1 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Zbed3Q9D0L1 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Zbed3Q9D0L1 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms